ntsyspc是一款十分实用的分子生物学分析软件，通过使用该软件，能进行生物群体聚类分析及相似性分析，分析RFLP，RAPD等电泳带型，计算遗传距离分析聚类树绘图。需要的朋友赶紧来本站下载吧！

ntsyspc介绍

ntsyspc是一款来自国外非常知名的分子生物学分析软件。主要可为从事生物研究者提供生物群体聚类分析及相似性分析，并自动计算相关遗传距离，分析聚类树绘图等操作，可利用Ntedit直接录入数据，从excel表中直接读入数据，还可以从文本文件进行读取数据。

使用说明

一、数据的处理

1、读板

2、把每一个引物的读板数据用Excel表格排成一列：

eg：10个材料用satt140读出5个多态性位点应列表——

3、再把上表列成NTSYS能识别的格式——

eg：10个材料用satt140读出5个多态性位点应列表——

(有带读1、无带读0、缺失读999)

注：一般情况下不只是satt140一个引物，而是多个引物，则应该把各个引物的如上数据合

成在一个工作簿中，并只保存一个工作表sheet1，输入完毕后，将文件以Microsoft excel 5.0/95工作薄的格式存盘，如下图——(这样就可以用NTSYS-pc分析)

二、NTSYSpc用法

1、生成矩阵：在excel按如下规则输入数据，A1=1表示有带记为1，B1=10表示扩增的总条带数， C1=5表示样本数，D1=0表示无带记为0。第二行表示的是样本名称。从第三行开始的A列表示引物名称。见下图：

输入完毕后，将文件以Microsoft excel 5.0/95工作薄的格式存盘。并且只能保存sheet1一个工作簿。(注：这里的B1和C1颠倒，应该在qualitative data一步中选by rows)

2、生成系统树：

打开NTSYS-PC程序，点击similarity出现如下界面

点击input file，打开生成的excel文件，点击out file起一个文件名(假设叫A)，然后点击compute按钮。继续点击clustering，出现下面的界面，

再点SHAN，出现如下界面：

点击input file，打开文件A，点击out file起一个文件名(假设叫B)，然后点击compute按钮。然后点Graphics